顯微鏡和圖像投射到探測器表面是兩維表示在三維空間中存在的對象。正如在第一部分中討論，圖像被分成一個二維陣列的像素圖形由X和Y軸代表。每個像素是一個典型的正方形區域的橫向分辨率和放大倍率的顯微鏡以及探測器陣列的物理尺寸決定。類似的像素在2D成像，量元素或像素，定義X，Y，Z軸的尺寸，是在三維成像的基本單位或抽樣量。

長期多維成像可以用來描述三維成像（3D體積），四維成像技術（4D;數量和時間），或在5個或更多維成像（5D，6D等，數量，時間，波長），分別代表不同的變量組合。

現代生物科技的應用越來越需要光學儀器和數字圖像處理系統，能夠捕捉定量，多維信息有關動態，空間復雜的標本。

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